南海水產(chǎn)研究所成立于 1953 年， 是我國最早建立的從事熱帶亞熱帶水產(chǎn)科學(xué)研究的非盈利公益型國家科研機構(gòu)。 全所現(xiàn)有職工 335 人，其中高級研究人員96人，國家級和省、部級有突出貢獻專家10名，享受政府特殊津貼專家26名，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院首席科學(xué)家4名；博士生導(dǎo)師5名，碩士生導(dǎo)師35名。

       所內(nèi)設(shè)有食品工程與質(zhì)量安全研究室、水產(chǎn)養(yǎng)殖與生物技術(shù)研究室、海洋漁業(yè)資源研究室、漁業(yè)生態(tài)環(huán)境研究室、漁業(yè)工程研究室和漁業(yè)生物病害防治研究室 6 個研究室；此外，還設(shè)有漁業(yè)信息中心、海南熱帶水產(chǎn)研發(fā)中心、深圳實驗基地、花都試驗基地、調(diào)查船基地和飼料與南海水產(chǎn)研究所科技服務(wù)公司。

       依托所內(nèi)各學(xué)科組建了國家水產(chǎn)品加工技術(shù)研發(fā)中心、農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品加工重點實驗室、農(nóng)業(yè)部南海漁業(yè)資源開發(fā)利用重點實驗室、農(nóng)業(yè)部華南水產(chǎn)品加工與質(zhì)量安全研究中心、農(nóng)業(yè)部漁業(yè)環(huán)境及水產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗測試中心（廣州）、農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品貯藏保鮮風(fēng)險評估實驗室（廣州）、廣東省漁業(yè)生態(tài)環(huán)境重點開放實驗室、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)種質(zhì)資源與健康養(yǎng)殖重點實驗室、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院海洋牧場技術(shù)重點實驗室、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院水產(chǎn)品加工及綜合利用工程技術(shù)研究中心、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院網(wǎng)箱工程技術(shù)研究中心、博士后科研工作站、農(nóng)業(yè)部南海區(qū)海水養(yǎng)殖病害防治研究中心、農(nóng)業(yè)部南海區(qū)漁業(yè)生態(tài)環(huán)境監(jiān)測中心、農(nóng)業(yè)部南海漁業(yè)資源與環(huán)境野外科學(xué)觀測試驗站、農(nóng)業(yè)部斑節(jié)對蝦遺傳育種研究中心、全國水產(chǎn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)化委員會漁業(yè)資源分技術(shù)委員會、廣東省水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會、人力資源和社會保障部特有工種技能鑒定站等19個部（省）、院級重點實驗室、研究中心、野外臺站等。

      建所以來，已經(jīng)承擔(dān)各級各類科研項目2652項，獲各類科研成果 840 余項，其中，國家級獎 16項，省、部級獎勵 260 項。2002-2012年，承擔(dān)包括國家自然科學(xué)基金、國家科技支撐計劃、國家863計劃等各類科研項目共1103 項，其中國家級項目281項、省部級項目644項；獲得各級成果獎勵104項次，其中國家獎3項，省（部）級一等獎5項、二等獎等52項。出版核心學(xué)術(shù)期刊《南方水產(chǎn)科學(xué)》，擁有華南地區(qū)貯藏量最豐富的熱帶亞熱帶海洋生物標(biāo)本館、新建了四大科學(xué)實驗基地和一艘千噸級海洋漁業(yè)科學(xué)調(diào)查船。這些成果，為促進我國水產(chǎn)科學(xué)技術(shù)發(fā)展和繁榮漁（農(nóng)）村經(jīng)濟做出了積極的貢獻。